本片描述几个少年，在数码科幻世界里的冒险和奋战的过程。故事是以七个小孩漂流到数码世界为开端，太一等突然被放逐到一个同时存在山、川、冰、河、热带雨林的谜一样的岛屿，在此与一直在等待太一一群人的七只幼年期的数码宝贝相遇。他们的旅程前方却充满着危机！接连不断而来的数码宝贝们的混战和数码世界之谜，以及阻碍着太一他们前进的恶敌！数码宝贝的世界和人类的世界，跨越两个世界