幻想乡咖啡店是江源理用一次咖啡师比赛所获奖金开的，可开业以来销售额一直为零有五位中二少年认定幻想乡位于次元的裂缝之中，他们决定拯救幻想乡，由此展开了种种令人啼笑皆非的日常。江源理在他们建议下入宅，并成立“幻想乡二中队”，过程中的六人产生了纯真友谊和莫名的羁绊。可突然有一天，江源理发现中二少年们不再中二，二次元一夜之间濒临消失，他决定查出事实真相，挽回朋友，拯救属于他们的二次元。